| ■システム第一グループ | システム開発における企画、設計、構築、運用を行う部門です。 |
| ■システム第二グループ | Webシステム開発に関する企画、設計、構築、運用を行う部門です。 |
| ■システム第三グループ | 出向・派遣を主としたシステム開発全般を支援する部門です。 |
| ■ソリューショングループ | マーケティング、インストラクション、環境整備など人的支援サービスを行う部門です。 |
| ■管理部経理課 | 契約管理、売上管理を含めた経理事務を行う部門です。 |
| ■管理部管理課 | エンジニアの技術サポートと業務進捗を行う部門です。 |
| ■営業部 | 新規案件の獲得、契約折衝を行う部門です。 |
| ■執行部 | 各プロジェクトの計画立案、会社全体の運営を検討する部門です。 |
| ■役員会 | 日本エンジニア株主で構成された役員会です。 |
| ■代表取締役社長 | 三田 克弘 |
